城市污水站的运行管理，同其他行业的运行管理一样，是企业生产活动进行计划、组织、控制和协调等工作的总称，是企业各种管理活动（例如：行政管理、技术管理、设备管理、“三产”管理）的一部分，是企业各种经营活动中最重要的部分。城市污水站的运行管理，指从接纳原污水至净化处理排出“达标”污水的全过程的管理。
一、污水处理运行管理的基本要求
城市污水站处理运行管理过程中的基本要求是： （1）按需生产，首先应满足城市与水环境对污水运行的基本要求，保证干处理量使处理后污水达标。 （2）经济生产，以最低的成本处理好污水，使其“达标”。 （3）文明生产，要求具有全新素质的操作管理人员，以先进的技术文明的方式，安全的搞好生产运行。
二、水质管理
污水处理站水质管理工作是各项工作的核心和目的，是保证“达标”的重要因素。水质管理制度应包括：各级水质管理机构责任制度，“三级”（指环保监测部门、总公司和污水站）检验制度，谁知排放标准与水质检验制度，水质控制与清洁生产制度等。
三、熟练掌握本职业务
污水与污泥的处理是依靠物理、化学及生物学的原理来完成的，要利用大型的构筑物、机械、设备与自控装置，还涉及各种测试手段，这就要求所有运行管理人员除了具有一定的文化程度外，在物理、化学及微生物学方面的知识应具有更高的要求，也包括机械及电方面的知识。
四、遵守规章制度
为了保证污水处理站稳定的运行，除了操作管理人员应具备业务知识和能力外，还应有一系列规章制度要共同遵守。除了岗位责任制以外，还包括：设施巡视制、设备保养制、交接班制、安全操作制等。
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